要使蛋白質變性，就要讓蜷曲、螺旋的蛋白質分子長鏈舒展、松弛，其中關鍵是破壞形成蜷曲和螺旋的力。酒精分子有兩個末端，一端是憎水的(一C2H5)，可以破壞蛋白質內部憎水基團之間的吸引力，一端是親水的(一OH)，但它難以破壞蛋白質外部的親水基團之間的吸引力。另一方面。水分子雖然可以松弛蛋白質親水基團之間的吸引力，但它即使鉆進細菌內部，也無法破壞其蛋白質中憎水基團之間的吸引力。所以，純酒精或水都不足以使細菌內的蛋白質變性，只有酒精和水共同存在，同時使保持蛋白質幾何形狀的吸引力松弛，蛋白質才會失去生理活性。因此，只有一定濃度的酒精溶液，才能達到良好的消毒殺菌目的。